因为棉花具有怕污染、怕湿、怕高温的特点，新疆铁路部门把棉花列入易燃货物，在设有风雨棚的站台集中堆码。在装车前，铁路工作人员还要对装运棉花的车辆进行清扫，使用原子灰、塑料布、泡沫胶对破损部位进行封堵，并在车厢底部衬垫瓦楞纸，避免长途运输棉包摩擦底板产生隐患。

新疆棉花种植区域地点分散、集中运输难度大，新疆铁路部门“主动出击”对接棉花、棉纱产业相关企业，根据企业的运输计划，精准制定个性化、多样化的运输方案，采取零星拼车、成组装车、开行专列等方式提升运力。同时，还持续拓展棉花装车站点，目前已在南疆铁路库尔勒西站、兰新铁路西段奎屯站等26条铁路专用线以及乌北站、巴楚站、新和站3个铁路货场开办了棉花运输业务，方便企业就近发运棉花。今年，新疆铁路部门还与全国棉花交易市场集团有限公司等3家客户签订合作协议，协议运量达170万吨，整合棉花优势资源，有效降低物流成本。